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Khnoum est représenté en bélier ou en homme à tête de bélier. A Esna il est associé à la déesse Neith, à Antinoé à la déesse Heqet et à Eléphantine à la déesse Satis et à leur déesse fille Anoukis. Associé à Neith, Khnoum est un démiurge qui, sur son tour de potier, a façonné "l'oeuf primordial" d'où a jailli le soleil au commencement des temps. A partir du Nouvel Empire, certains pharaons, se réclamant fils de Rê, attribuent leur naissance à Khnoum et Heqet. Ils apparaissent ainsi sur les scènes de théogamie lors des naissances royales. Avec Satis et Anoukis, Khnoum est le patron de la 1ère cataracte et le gardien des cavernes mythiques d'où le Nil prendrait sa source.