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Nefertoum est représenté en homme coiffé d'une fleur de lotus ou en enfant, le doigt à la bouche, assis sur une fleur de lotus. Il est associé en tant que dieu fils au dieu Ptah et à la déesse Sekhmet. Son lieu de culte principal était à Memphis. Il incarne le bouton de lotus aux pétales fermés qui flotte sur le Noun. Selon la légende, le matin le lotus s'épanouit et de ses pétales ouverts jaillit Rê, le soleil. Le soir, lorsqu'il arrive à l'Occident, Rê se réfugie dans le lotus qui referme alors son calice.